MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanococcus maripaludis S2 chromosome

Total Repeats: 39416

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005791	T	7	7	2	8	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005791	CCA	2	6	90	95	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_005791	AGG	2	6	119	124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005791	GGGAT	2	10	142	151	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005791	CTC	2	6	161	166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_005791	TTAAA	2	10	190	199	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005791	TCT	2	6	324	329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_005791	GCT	2	6	421	426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_005791	CAG	2	6	522	527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_005791	CAAC	2	8	532	539	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_005791	ACG	2	6	547	552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_005791	CTG	2	6	608	613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_005791	T	6	6	708	713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005791	CAA	2	6	790	795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_005791	GGCT	2	8	801	808	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_005791	CCT	2	6	863	868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_005791	AGG	2	6	880	885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005791	GTG	2	6	955	960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005791	CCG	2	6	1225	1230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_005791	AC	3	6	1299	1304	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_005791	AT	3	6	1378	1383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005791	CCT	2	6	1564	1569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_005791	TCA	2	6	1580	1585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_005791	TTA	2	6	1605	1610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005791	AAG	2	6	1747	1752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005791	CGG	2	6	1819	1824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_005791	TAC	3	9	1852	1860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_005791	C	6	6	1924	1929	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_005791	CGG	2	6	1961	1966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_005791	GCT	2	6	2039	2044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_005791	CTG	2	6	2060	2065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_005791	CGA	3	9	2186	2194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_005791	TTC	2	6	2227	2232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_005791	ACC	2	6	2238	2243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_005791	AGA	2	6	2356	2361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005791	CAA	2	6	2375	2380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_005791	TTG	2	6	2504	2509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005791	CCTACG	2	12	2515	2526	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_005791	CAA	2	6	2551	2556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_005791	GAC	2	6	2585	2590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_005791	CATAC	2	10	2665	2674	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_005791	CG	3	6	2798	2803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_005791	AAG	2	6	2919	2924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005791	TAA	2	6	2988	2993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005791	CCAAG	2	10	3165	3174	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_005791	ATA	2	6	3274	3279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005791	TAG	2	6	3328	3333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005791	T	7	7	3346	3352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005791	AGG	2	6	3353	3358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005791	C	6	6	3404	3409	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
51	NC_005791	AAGGCC	2	12	3438	3449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_005791	GTG	2	6	3469	3474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005791	GT	3	6	3484	3489	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005791	TAT	2	6	3518	3523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005791	TAC	2	6	3534	3539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_005791	TCCT	2	8	3700	3707	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_005791	GGA	2	6	3749	3754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005791	CAC	2	6	3837	3842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_005791	GTC	2	6	3863	3868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_005791	TCA	2	6	3879	3884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_005791	GGC	2	6	4001	4006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_005791	GGT	2	6	4168	4173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005791	CAG	2	6	4240	4245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_005791	CCA	2	6	4334	4339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_005791	GCT	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_005791	C	6	6	4449	4454	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
67	NC_005791	CTG	2	6	4488	4493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_005791	CT	3	6	4542	4547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_005791	TGG	2	6	4572	4577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005791	CCA	2	6	4587	4592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_005791	TAT	2	6	4674	4679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005791	CGG	2	6	4801	4806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_005791	TAG	2	6	4820	4825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005791	ATA	2	6	4969	4974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005791	TA	3	6	5021	5026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005791	A	8	8	5026	5033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005791	CCA	2	6	5131	5136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_005791	AGG	2	6	5160	5165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005791	GGGAT	2	10	5183	5192	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005791	CTC	2	6	5202	5207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_005791	TTAAA	2	10	5231	5240	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005791	TCT	2	6	5365	5370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_005791	GCT	2	6	5462	5467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_005791	CAG	2	6	5563	5568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_005791	CAAC	2	8	5573	5580	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_005791	ACG	2	6	5588	5593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_005791	CTG	2	6	5649	5654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_005791	T	6	6	5749	5754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005791	CAA	2	6	5831	5836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_005791	GGCT	2	8	5842	5849	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_005791	CCT	2	6	5904	5909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_005791	AGG	2	6	5921	5926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005791	GTG	2	6	5996	6001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005791	CCG	2	6	6266	6271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_005791	AC	3	6	6340	6345	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_005791	AT	3	6	6419	6424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005791	CCT	2	6	6605	6610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_005791	TCA	2	6	6621	6626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_005791	TTA	2	6	6646	6651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005791	AAG	2	6	6788	6793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005791	CGG	2	6	6860	6865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_005791	TAC	3	9	6893	6901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_005791	C	6	6	6965	6970	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
104	NC_005791	CGG	2	6	7002	7007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_005791	GCT	2	6	7080	7085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_005791	CTG	2	6	7101	7106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_005791	CGA	3	9	7227	7235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_005791	TTC	2	6	7268	7273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_005791	ACC	2	6	7279	7284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_005791	AGA	2	6	7397	7402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005791	CAA	2	6	7416	7421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_005791	TTG	2	6	7545	7550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005791	CCTACG	2	12	7556	7567	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
114	NC_005791	CAA	2	6	7592	7597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_005791	GAC	2	6	7626	7631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_005791	CATAC	2	10	7706	7715	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_005791	CG	3	6	7839	7844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_005791	AAG	2	6	7960	7965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005791	TAA	2	6	8029	8034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005791	CCAAG	2	10	8206	8215	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_005791	ATA	2	6	8315	8320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_005791	TAG	2	6	8369	8374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005791	T	7	7	8387	8393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_005791	AGG	2	6	8394	8399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_005791	C	6	6	8445	8450	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
126	NC_005791	AAGGCC	2	12	8479	8490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_005791	GTG	2	6	8510	8515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_005791	GT	3	6	8525	8530	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005791	TAT	2	6	8559	8564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_005791	TAC	2	6	8575	8580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_005791	TCCT	2	8	8741	8748	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_005791	GGA	2	6	8790	8795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_005791	CAC	2	6	8878	8883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_005791	GTC	2	6	8904	8909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_005791	TCA	2	6	8920	8925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_005791	GGC	2	6	9042	9047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_005791	GGT	2	6	9209	9214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005791	CAG	2	6	9281	9286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_005791	CCA	2	6	9375	9380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_005791	GCT	2	6	9404	9409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_005791	C	6	6	9490	9495	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
142	NC_005791	CTG	2	6	9529	9534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_005791	CT	3	6	9583	9588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_005791	TGG	2	6	9613	9618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_005791	CCA	2	6	9628	9633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_005791	TAT	2	6	9715	9720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_005791	CGG	2	6	9842	9847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_005791	TAG	2	6	9861	9866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_005791	ATA	2	6	10010	10015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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